Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm5Q9CXE0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm5Q9CXE0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm5Q9CXE0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm5Q9CXE0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm5Q9CXE0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm5Q9CXE0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm5Q9CXE0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm5Q9CXE0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm5Q9CXE0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm5Q9CXE0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm5Q9CXE0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm5Q9CXE0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm5Q9CXE0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm5Q9CXE0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm5Q9CXE0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm5Q9CXE0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm5Q9CXE0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm5Q9CXE0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm5Q9CXE0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm5Q9CXE0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm5Q9CXE0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm5Q9CXE0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm5Q9CXE0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm5Q9CXE0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm5Q9CXE0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm5Q9CXE0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm5Q9CXE0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm5Q9CXE0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm5Q9CXE0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm5Q9CXE0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm5Q9CXE0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm5Q9CXE0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm5Q9CXE0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm5Q9CXE0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm5Q9CXE0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm5Q9CXE0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm5Q9CXE0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm5Q9CXE0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm5Q9CXE0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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