Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmd8Q9CX56 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psmd8Q9CX56 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmd8Q9CX56 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms