Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NubplQ9CWD8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NubplQ9CWD8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NubplQ9CWD8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms