Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930535I16RikQ9CUI2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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4930535I16RikQ9CUI2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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4930535I16RikQ9CUI2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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4930535I16RikQ9CUI2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930535I16RikQ9CUI2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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4930535I16RikQ9CUI2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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4930535I16RikQ9CUI2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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4930535I16RikQ9CUI2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930535I16RikQ9CUI2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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4930535I16RikQ9CUI2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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