Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc96Q9CR92 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc96Q9CR92 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc96Q9CR92 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc96Q9CR92 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc96Q9CR92 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc96Q9CR92 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc96Q9CR92 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc96Q9CR92 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc96Q9CR92 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc96Q9CR92 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc96Q9CR92 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc96Q9CR92 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc96Q9CR92 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc96Q9CR92 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc96Q9CR92 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc96Q9CR92 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc96Q9CR92 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc96Q9CR92 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc96Q9CR92 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc96Q9CR92 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc96Q9CR92 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc96Q9CR92 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc96Q9CR92 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc96Q9CR92 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc96Q9CR92 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc96Q9CR92 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc96Q9CR92 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc96Q9CR92 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc96Q9CR92 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc96Q9CR92 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc96Q9CR92 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc96Q9CR92 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc96Q9CR92 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc96Q9CR92 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc96Q9CR92 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc96Q9CR92 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc96Q9CR92 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc96Q9CR92 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc96Q9CR92 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc96Q9CR92 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms