Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR25

Dph2, 2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph2Q9CR25 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dph2Q9CR25 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Dph2Q9CR25 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Dph2Q9CR25 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dph2Q9CR25 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dph2Q9CR25 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dph2Q9CR25 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dph2Q9CR25 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dph2Q9CR25 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dph2Q9CR25 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dph2Q9CR25 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dph2Q9CR25 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Dph2Q9CR25 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dph2Q9CR25 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dph2Q9CR25 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dph2Q9CR25 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dph2Q9CR25 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dph2Q9CR25 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dph2Q9CR25 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Dph2Q9CR25 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dph2Q9CR25 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dph2Q9CR25 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dph2Q9CR25 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dph2Q9CR25 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dph2Q9CR25 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dph2Q9CR25 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dph2Q9CR25 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms