Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR16

Ppid, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpidQ9CR16 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PpidQ9CR16 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PpidQ9CR16 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PpidQ9CR16 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PpidQ9CR16 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PpidQ9CR16 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpidQ9CR16 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpidQ9CR16 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpidQ9CR16 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpidQ9CR16 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PpidQ9CR16 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PpidQ9CR16 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PpidQ9CR16 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PpidQ9CR16 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PpidQ9CR16 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PpidQ9CR16 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PpidQ9CR16 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpidQ9CR16 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms