Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV1

Pam16, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM16, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pam16Q9CQV1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pam16Q9CQV1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pam16Q9CQV1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pam16Q9CQV1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pam16Q9CQV1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pam16Q9CQV1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pam16Q9CQV1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pam16Q9CQV1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pam16Q9CQV1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pam16Q9CQV1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pam16Q9CQV1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pam16Q9CQV1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pam16Q9CQV1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pam16Q9CQV1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pam16Q9CQV1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pam16Q9CQV1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pam16Q9CQV1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pam16Q9CQV1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pam16Q9CQV1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pam16Q9CQV1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pam16Q9CQV1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pam16Q9CQV1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms