Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ndufb9Q9CQJ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ndufb9Q9CQJ8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ndufb9Q9CQJ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ndufb9Q9CQJ8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ndufb9Q9CQJ8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ndufb9Q9CQJ8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ndufb9Q9CQJ8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ndufb9Q9CQJ8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ndufb9Q9CQJ8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ndufb9Q9CQJ8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ndufb9Q9CQJ8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ndufb9Q9CQJ8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ndufb9Q9CQJ8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms