Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufb5Q9CQH3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufb5Q9CQH3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufb5Q9CQH3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufb5Q9CQH3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ndufb5Q9CQH3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ndufb5Q9CQH3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndufb5Q9CQH3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufb5Q9CQH3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufb5Q9CQH3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufb5Q9CQH3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufb5Q9CQH3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufb5Q9CQH3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufb5Q9CQH3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufb5Q9CQH3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufb5Q9CQH3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufb5Q9CQH3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufb5Q9CQH3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ndufb5Q9CQH3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ndufb5Q9CQH3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ndufb5Q9CQH3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Ndufb5Q9CQH3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufb5Q9CQH3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufb5Q9CQH3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufb5Q9CQH3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufb5Q9CQH3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ndufb5Q9CQH3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ndufb5Q9CQH3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufb5Q9CQH3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufb5Q9CQH3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufb5Q9CQH3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufb5Q9CQH3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufb5Q9CQH3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufb5Q9CQH3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufb5Q9CQH3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufb5Q9CQH3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufb5Q9CQH3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufb5Q9CQH3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufb5Q9CQH3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufb5Q9CQH3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms