Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP0

Npm3, Nucleoplasmin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm3Q9CPP0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm3Q9CPP0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm3Q9CPP0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm3Q9CPP0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm3Q9CPP0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm3Q9CPP0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm3Q9CPP0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm3Q9CPP0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm3Q9CPP0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm3Q9CPP0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm3Q9CPP0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm3Q9CPP0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm3Q9CPP0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm3Q9CPP0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm3Q9CPP0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm3Q9CPP0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm3Q9CPP0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Npm3Q9CPP0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npm3Q9CPP0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Npm3Q9CPP0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Npm3Q9CPP0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Npm3Q9CPP0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Npm3Q9CPP0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Npm3Q9CPP0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Npm3Q9CPP0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Npm3Q9CPP0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Npm3Q9CPP0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Npm3Q9CPP0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Npm3Q9CPP0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Npm3Q9CPP0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Npm3Q9CPP0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Npm3Q9CPP0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Npm3Q9CPP0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Npm3Q9CPP0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Npm3Q9CPP0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Npm3Q9CPP0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Npm3Q9CPP0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Npm3Q9CPP0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Npm3Q9CPP0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms