Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC39A8Q9C0K1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC39A8Q9C0K1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC39A8Q9C0K1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC39A8Q9C0K1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC39A8Q9C0K1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC39A8Q9C0K1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC39A8Q9C0K1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC39A8Q9C0K1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC39A8Q9C0K1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC39A8Q9C0K1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC39A8Q9C0K1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC39A8Q9C0K1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC39A8Q9C0K1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC39A8Q9C0K1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC39A8Q9C0K1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC39A8Q9C0K1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC39A8Q9C0K1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC39A8Q9C0K1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC39A8Q9C0K1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC39A8Q9C0K1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC39A8Q9C0K1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC39A8Q9C0K1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC39A8Q9C0K1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC39A8Q9C0K1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC39A8Q9C0K1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC39A8Q9C0K1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms