Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CFAP74Q9C0B2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
CFAP74Q9C0B2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CFAP74Q9C0B2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CFAP74Q9C0B2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CFAP74Q9C0B2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
CFAP74Q9C0B2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CFAP74Q9C0B2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CFAP74Q9C0B2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CFAP74Q9C0B2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
CFAP74Q9C0B2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CFAP74Q9C0B2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CFAP74Q9C0B2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CFAP74Q9C0B2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
CFAP74Q9C0B2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
CFAP74Q9C0B2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CFAP74Q9C0B2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.8
CFAP74Q9C0B2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
CFAP74Q9C0B2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CFAP74Q9C0B2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CFAP74Q9C0B2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CFAP74Q9C0B2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
CFAP74Q9C0B2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CFAP74Q9C0B2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CFAP74Q9C0B2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CFAP74Q9C0B2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CFAP74Q9C0B2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CFAP74Q9C0B2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CFAP74Q9C0B2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CFAP74Q9C0B2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CFAP74Q9C0B2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
CFAP74Q9C0B2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CFAP74Q9C0B2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CFAP74Q9C0B2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CFAP74Q9C0B2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CFAP74Q9C0B2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CFAP74Q9C0B2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CFAP74Q9C0B2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CFAP74Q9C0B2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CFAP74Q9C0B2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CFAP74Q9C0B2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CFAP74Q9C0B2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CFAP74Q9C0B2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
CFAP74Q9C0B2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CFAP74Q9C0B2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CFAP74Q9C0B2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CFAP74Q9C0B2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CFAP74Q9C0B2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
CFAP74Q9C0B2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CFAP74Q9C0B2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
CFAP74Q9C0B2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CFAP74Q9C0B2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CFAP74Q9C0B2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
CFAP74Q9C0B2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CFAP74Q9C0B2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CFAP74Q9C0B2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CFAP74Q9C0B2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CFAP74Q9C0B2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CFAP74Q9C0B2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CFAP74Q9C0B2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CFAP74Q9C0B2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CFAP74Q9C0B2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CFAP74Q9C0B2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CFAP74Q9C0B2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CFAP74Q9C0B2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CFAP74Q9C0B2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
CFAP74Q9C0B2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms