Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CNTNAP4Q9C0A0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CNTNAP4Q9C0A0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CNTNAP4Q9C0A0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CNTNAP4Q9C0A0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNTNAP4Q9C0A0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNTNAP4Q9C0A0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNTNAP4Q9C0A0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CNTNAP4Q9C0A0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNTNAP4Q9C0A0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNTNAP4Q9C0A0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNTNAP4Q9C0A0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CNTNAP4Q9C0A0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CNTNAP4Q9C0A0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CNTNAP4Q9C0A0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CNTNAP4Q9C0A0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CNTNAP4Q9C0A0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CNTNAP4Q9C0A0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CNTNAP4Q9C0A0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CNTNAP4Q9C0A0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CNTNAP4Q9C0A0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CNTNAP4Q9C0A0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CNTNAP4Q9C0A0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CNTNAP4Q9C0A0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CNTNAP4Q9C0A0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CNTNAP4Q9C0A0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CNTNAP4Q9C0A0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CNTNAP4Q9C0A0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CNTNAP4Q9C0A0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CNTNAP4Q9C0A0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CNTNAP4Q9C0A0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CNTNAP4Q9C0A0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CNTNAP4Q9C0A0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CNTNAP4Q9C0A0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CNTNAP4Q9C0A0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CNTNAP4Q9C0A0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CNTNAP4Q9C0A0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
CNTNAP4Q9C0A0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CNTNAP4Q9C0A0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CNTNAP4Q9C0A0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CNTNAP4Q9C0A0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CNTNAP4Q9C0A0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CNTNAP4Q9C0A0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CNTNAP4Q9C0A0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CNTNAP4Q9C0A0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CNTNAP4Q9C0A0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CNTNAP4Q9C0A0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CNTNAP4Q9C0A0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CNTNAP4Q9C0A0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CNTNAP4Q9C0A0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CNTNAP4Q9C0A0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CNTNAP4Q9C0A0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CNTNAP4Q9C0A0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CNTNAP4Q9C0A0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CNTNAP4Q9C0A0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CNTNAP4Q9C0A0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CNTNAP4Q9C0A0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CNTNAP4Q9C0A0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CNTNAP4Q9C0A0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CNTNAP4Q9C0A0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CNTNAP4Q9C0A0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CNTNAP4Q9C0A0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CNTNAP4Q9C0A0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CNTNAP4Q9C0A0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CNTNAP4Q9C0A0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms