Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU5

KRTAP2-1, Keratin-associated protein 2-1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-1Q9BYU5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP2-1Q9BYU5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP2-1Q9BYU5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms