Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP9-3Q9BYQ3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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KRTAP9-3Q9BYQ3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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KRTAP9-3Q9BYQ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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