Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
YTHDF1Q9BYJ9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
YTHDF1Q9BYJ9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms