Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PCGF6Q9BYE7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PCGF6Q9BYE7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PCGF6Q9BYE7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PCGF6Q9BYE7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PCGF6Q9BYE7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
PCGF6Q9BYE7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PCGF6Q9BYE7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PCGF6Q9BYE7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
PCGF6Q9BYE7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
PCGF6Q9BYE7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PCGF6Q9BYE7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PCGF6Q9BYE7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
PCGF6Q9BYE7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PCGF6Q9BYE7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PCGF6Q9BYE7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PCGF6Q9BYE7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PCGF6Q9BYE7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PCGF6Q9BYE7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
PCGF6Q9BYE7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
PCGF6Q9BYE7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PCGF6Q9BYE7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
PCGF6Q9BYE7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
PCGF6Q9BYE7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PCGF6Q9BYE7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PCGF6Q9BYE7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
PCGF6Q9BYE7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC38.65■■■■□ 3.78
PCGF6Q9BYE7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PCGF6Q9BYE7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PCGF6Q9BYE7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PCGF6Q9BYE7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PCGF6Q9BYE7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
PCGF6Q9BYE7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
PCGF6Q9BYE7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
PCGF6Q9BYE7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PCGF6Q9BYE7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
PCGF6Q9BYE7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PCGF6Q9BYE7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PCGF6Q9BYE7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PCGF6Q9BYE7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PCGF6Q9BYE7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PCGF6Q9BYE7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PCGF6Q9BYE7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PCGF6Q9BYE7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PCGF6Q9BYE7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PCGF6Q9BYE7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PCGF6Q9BYE7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PCGF6Q9BYE7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PCGF6Q9BYE7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PCGF6Q9BYE7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PCGF6Q9BYE7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PCGF6Q9BYE7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms