Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC11CQ9BY50 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC11CQ9BY50 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC11CQ9BY50 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms