Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS5

AP1M1, AP-1 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1M1Q9BXS5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP1M1Q9BXS5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP1M1Q9BXS5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP1M1Q9BXS5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP1M1Q9BXS5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP1M1Q9BXS5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP1M1Q9BXS5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
AP1M1Q9BXS5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP1M1Q9BXS5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP1M1Q9BXS5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP1M1Q9BXS5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP1M1Q9BXS5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP1M1Q9BXS5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP1M1Q9BXS5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
AP1M1Q9BXS5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP1M1Q9BXS5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
AP1M1Q9BXS5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AP1M1Q9BXS5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AP1M1Q9BXS5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AP1M1Q9BXS5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms