Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL25A1Q9BXS0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL25A1Q9BXS0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL25A1Q9BXS0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL25A1Q9BXS0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL25A1Q9BXS0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL25A1Q9BXS0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL25A1Q9BXS0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
COL25A1Q9BXS0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL25A1Q9BXS0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL25A1Q9BXS0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
COL25A1Q9BXS0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
COL25A1Q9BXS0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL25A1Q9BXS0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
COL25A1Q9BXS0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL25A1Q9BXS0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL25A1Q9BXS0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL25A1Q9BXS0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL25A1Q9BXS0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL25A1Q9BXS0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL25A1Q9BXS0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL25A1Q9BXS0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL25A1Q9BXS0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL25A1Q9BXS0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL25A1Q9BXS0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms