Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF4Q9BUZ4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms