Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSEN34Q9BSV6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSEN34Q9BSV6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSEN34Q9BSV6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSEN34Q9BSV6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSEN34Q9BSV6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSEN34Q9BSV6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TSEN34Q9BSV6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSEN34Q9BSV6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TSEN34Q9BSV6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TSEN34Q9BSV6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TSEN34Q9BSV6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TSEN34Q9BSV6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TSEN34Q9BSV6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TSEN34Q9BSV6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TSEN34Q9BSV6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSEN34Q9BSV6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSEN34Q9BSV6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSEN34Q9BSV6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSEN34Q9BSV6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TSEN34Q9BSV6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSEN34Q9BSV6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSEN34Q9BSV6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TSEN34Q9BSV6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSEN34Q9BSV6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSEN34Q9BSV6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSEN34Q9BSV6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSEN34Q9BSV6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSEN34Q9BSV6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TSEN34Q9BSV6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSEN34Q9BSV6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSEN34Q9BSV6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSEN34Q9BSV6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSEN34Q9BSV6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSEN34Q9BSV6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSEN34Q9BSV6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSEN34Q9BSV6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSEN34Q9BSV6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSEN34Q9BSV6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSEN34Q9BSV6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSEN34Q9BSV6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSEN34Q9BSV6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSEN34Q9BSV6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSEN34Q9BSV6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TSEN34Q9BSV6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSEN34Q9BSV6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSEN34Q9BSV6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSEN34Q9BSV6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSEN34Q9BSV6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms