Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG101Q9BSB4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG101Q9BSB4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG101Q9BSB4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG101Q9BSB4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG101Q9BSB4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG101Q9BSB4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG101Q9BSB4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG101Q9BSB4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG101Q9BSB4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG101Q9BSB4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG101Q9BSB4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG101Q9BSB4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATG101Q9BSB4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG101Q9BSB4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG101Q9BSB4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms