Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIKE1Q9BRV8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIKE1Q9BRV8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIKE1Q9BRV8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms