Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VPS25Q9BRG1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms