Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPPED1Q9BRF8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPPED1Q9BRF8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPPED1Q9BRF8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPPED1Q9BRF8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPPED1Q9BRF8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPPED1Q9BRF8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPPED1Q9BRF8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPPED1Q9BRF8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPPED1Q9BRF8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CPPED1Q9BRF8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPPED1Q9BRF8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPPED1Q9BRF8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms