Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMSS1Q9BQ75 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMSS1Q9BQ75 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMSS1Q9BQ75 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMSS1Q9BQ75 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMSS1Q9BQ75 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMSS1Q9BQ75 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CMSS1Q9BQ75 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMSS1Q9BQ75 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMSS1Q9BQ75 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMSS1Q9BQ75 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMSS1Q9BQ75 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMSS1Q9BQ75 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMSS1Q9BQ75 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMSS1Q9BQ75 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMSS1Q9BQ75 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMSS1Q9BQ75 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CMSS1Q9BQ75 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMSS1Q9BQ75 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms