Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMIM7Q9BQ49 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMIM7Q9BQ49 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
SMIM7Q9BQ49 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms