Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ino80bQ99PT3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ino80bQ99PT3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ino80bQ99PT3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ino80bQ99PT3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ino80bQ99PT3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ino80bQ99PT3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ino80bQ99PT3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ino80bQ99PT3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ino80bQ99PT3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ino80bQ99PT3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ino80bQ99PT3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ino80bQ99PT3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ino80bQ99PT3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ino80bQ99PT3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ino80bQ99PT3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ino80bQ99PT3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ino80bQ99PT3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ino80bQ99PT3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ino80bQ99PT3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ino80bQ99PT3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ino80bQ99PT3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ino80bQ99PT3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms