Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim12aQ99PQ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim12aQ99PQ1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim12aQ99PQ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim12aQ99PQ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim12aQ99PQ1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim12aQ99PQ1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim12aQ99PQ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim12aQ99PQ1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim12aQ99PQ1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim12aQ99PQ1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim12aQ99PQ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim12aQ99PQ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim12aQ99PQ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim12aQ99PQ1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim12aQ99PQ1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim12aQ99PQ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim12aQ99PQ1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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