Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trim26Q99PN3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trim26Q99PN3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trim26Q99PN3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trim26Q99PN3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Trim26Q99PN3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim26Q99PN3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim26Q99PN3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trim26Q99PN3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim26Q99PN3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim26Q99PN3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim26Q99PN3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim26Q99PN3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim26Q99PN3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trim26Q99PN3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trim26Q99PN3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trim26Q99PN3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trim26Q99PN3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trim26Q99PN3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trim26Q99PN3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trim26Q99PN3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trim26Q99PN3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim26Q99PN3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim26Q99PN3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim26Q99PN3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim26Q99PN3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim26Q99PN3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trim26Q99PN3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trim26Q99PN3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Trim26Q99PN3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Trim26Q99PN3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trim26Q99PN3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trim26Q99PN3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim26Q99PN3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim26Q99PN3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim26Q99PN3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim26Q99PN3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim26Q99PN3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms