Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smim3Q99PE5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smim3Q99PE5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smim3Q99PE5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim3Q99PE5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smim3Q99PE5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smim3Q99PE5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms