Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Nup155Q99P88 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Nup155Q99P88 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Nup155Q99P88 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.01
Nup155Q99P88 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Nup155Q99P88 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Nup155Q99P88 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Nup155Q99P88 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Nup155Q99P88 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Nup155Q99P88 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Nup155Q99P88 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Nup155Q99P88 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Nup155Q99P88 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Nup155Q99P88 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Nup155Q99P88 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Nup155Q99P88 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Nup155Q99P88 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Nup155Q99P88 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Nup155Q99P88 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Nup155Q99P88 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Nup155Q99P88 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Nup155Q99P88 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Nup155Q99P88 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Nup155Q99P88 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Nup155Q99P88 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Nup155Q99P88 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Nup155Q99P88 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Nup155Q99P88 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Nup155Q99P88 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Nup155Q99P88 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Nup155Q99P88 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Nup155Q99P88 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Nup155Q99P88 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Nup155Q99P88 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Nup155Q99P88 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Nup155Q99P88 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Nup155Q99P88 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.77■■■■□ 3
Nup155Q99P88 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Nup155Q99P88 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Nup155Q99P88 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
Nup155Q99P88 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Nup155Q99P88 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nup155Q99P88 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nup155Q99P88 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nup155Q99P88 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nup155Q99P88 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Nup155Q99P88 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Nup155Q99P88 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Nup155Q99P88 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Nup155Q99P88 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Nup155Q99P88 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Nup155Q99P88 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Nup155Q99P88 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Nup155Q99P88 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Nup155Q99P88 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Nup155Q99P88 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Nup155Q99P88 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Nup155Q99P88 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Nup155Q99P88 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Nup155Q99P88 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Nup155Q99P88 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Nup155Q99P88 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Nup155Q99P88 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Nup155Q99P88 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Nup155Q99P88 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Nup155Q99P88 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Nup155Q99P88 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Nup155Q99P88 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Nup155Q99P88 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Nup155Q99P88 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Nup155Q99P88 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Nup155Q99P88 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Nup155Q99P88 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Nup155Q99P88 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Nup155Q99P88 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Nup155Q99P88 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Nup155Q99P88 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Nup155Q99P88 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Nup155Q99P88 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Nup155Q99P88 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Nup155Q99P88 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Nup155Q99P88 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Nup155Q99P88 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Nup155Q99P88 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Nup155Q99P88 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Nup155Q99P88 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Nup155Q99P88 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Nup155Q99P88 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nup155Q99P88 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nup155Q99P88 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nup155Q99P88 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nup155Q99P88 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nup155Q99P88 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Nup155Q99P88 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Nup155Q99P88 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Nup155Q99P88 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Nup155Q99P88 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Nup155Q99P88 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Nup155Q99P88 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Nup155Q99P88 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms