Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rtn4Q99P72 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rtn4Q99P72 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rtn4Q99P72 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rtn4Q99P72 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rtn4Q99P72 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rtn4Q99P72 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rtn4Q99P72 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rtn4Q99P72 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rtn4Q99P72 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rtn4Q99P72 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rtn4Q99P72 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rtn4Q99P72 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rtn4Q99P72 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rtn4Q99P72 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rtn4Q99P72 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rtn4Q99P72 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rtn4Q99P72 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rtn4Q99P72 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rtn4Q99P72 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rtn4Q99P72 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rtn4Q99P72 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rtn4Q99P72 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rtn4Q99P72 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rtn4Q99P72 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rtn4Q99P72 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rtn4Q99P72 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rtn4Q99P72 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rtn4Q99P72 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rtn4Q99P72 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rtn4Q99P72 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rtn4Q99P72 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rtn4Q99P72 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rtn4Q99P72 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rtn4Q99P72 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rtn4Q99P72 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rtn4Q99P72 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms