Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Rad54l2Q99NG0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Rad54l2Q99NG0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Rad54l2Q99NG0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Rad54l2Q99NG0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Rad54l2Q99NG0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Rad54l2Q99NG0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Rad54l2Q99NG0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Rad54l2Q99NG0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Rad54l2Q99NG0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Rad54l2Q99NG0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Rad54l2Q99NG0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rad54l2Q99NG0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rad54l2Q99NG0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rad54l2Q99NG0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Rad54l2Q99NG0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rad54l2Q99NG0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rad54l2Q99NG0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Rad54l2Q99NG0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Rad54l2Q99NG0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Rad54l2Q99NG0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rad54l2Q99NG0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rad54l2Q99NG0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Rad54l2Q99NG0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rad54l2Q99NG0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rad54l2Q99NG0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Rad54l2Q99NG0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Rad54l2Q99NG0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Rad54l2Q99NG0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Rad54l2Q99NG0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Rad54l2Q99NG0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Rad54l2Q99NG0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rad54l2Q99NG0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rad54l2Q99NG0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rad54l2Q99NG0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Rad54l2Q99NG0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Rad54l2Q99NG0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Rad54l2Q99NG0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Rad54l2Q99NG0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Rad54l2Q99NG0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rad54l2Q99NG0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rad54l2Q99NG0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rad54l2Q99NG0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rad54l2Q99NG0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rad54l2Q99NG0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rad54l2Q99NG0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rad54l2Q99NG0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rad54l2Q99NG0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Rad54l2Q99NG0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Rad54l2Q99NG0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Rad54l2Q99NG0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Rad54l2Q99NG0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Rad54l2Q99NG0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Rad54l2Q99NG0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Rad54l2Q99NG0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Rad54l2Q99NG0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Rad54l2Q99NG0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Rad54l2Q99NG0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Rad54l2Q99NG0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Rad54l2Q99NG0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rad54l2Q99NG0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rad54l2Q99NG0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rad54l2Q99NG0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rad54l2Q99NG0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Rad54l2Q99NG0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Rad54l2Q99NG0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rad54l2Q99NG0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rad54l2Q99NG0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rad54l2Q99NG0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rad54l2Q99NG0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rad54l2Q99NG0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rad54l2Q99NG0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rad54l2Q99NG0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rad54l2Q99NG0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rad54l2Q99NG0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rad54l2Q99NG0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Rad54l2Q99NG0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Rad54l2Q99NG0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Rad54l2Q99NG0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rad54l2Q99NG0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Rad54l2Q99NG0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms