Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brms1Q99N20 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brms1Q99N20 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brms1Q99N20 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brms1Q99N20 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brms1Q99N20 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brms1Q99N20 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brms1Q99N20 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brms1Q99N20 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brms1Q99N20 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brms1Q99N20 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Brms1Q99N20 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brms1Q99N20 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brms1Q99N20 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brms1Q99N20 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brms1Q99N20 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brms1Q99N20 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brms1Q99N20 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brms1Q99N20 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brms1Q99N20 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brms1Q99N20 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brms1Q99N20 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brms1Q99N20 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brms1Q99N20 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brms1Q99N20 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Brms1Q99N20 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brms1Q99N20 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Brms1Q99N20 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Brms1Q99N20 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brms1Q99N20 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brms1Q99N20 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brms1Q99N20 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brms1Q99N20 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brms1Q99N20 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brms1Q99N20 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brms1Q99N20 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brms1Q99N20 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brms1Q99N20 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brms1Q99N20 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Brms1Q99N20 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brms1Q99N20 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms