Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Hdac9Q99N13 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hdac9Q99N13 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hdac9Q99N13 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hdac9Q99N13 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hdac9Q99N13 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Hdac9Q99N13 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hdac9Q99N13 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hdac9Q99N13 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Hdac9Q99N13 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hdac9Q99N13 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hdac9Q99N13 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hdac9Q99N13 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hdac9Q99N13 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hdac9Q99N13 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Hdac9Q99N13 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hdac9Q99N13 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hdac9Q99N13 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hdac9Q99N13 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Hdac9Q99N13 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hdac9Q99N13 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hdac9Q99N13 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hdac9Q99N13 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hdac9Q99N13 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hdac9Q99N13 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hdac9Q99N13 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hdac9Q99N13 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Hdac9Q99N13 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hdac9Q99N13 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hdac9Q99N13 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hdac9Q99N13 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hdac9Q99N13 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hdac9Q99N13 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hdac9Q99N13 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdac9Q99N13 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdac9Q99N13 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdac9Q99N13 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdac9Q99N13 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdac9Q99N13 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdac9Q99N13 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hdac9Q99N13 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hdac9Q99N13 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hdac9Q99N13 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hdac9Q99N13 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hdac9Q99N13 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac9Q99N13 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac9Q99N13 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac9Q99N13 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac9Q99N13 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hdac9Q99N13 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hdac9Q99N13 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hdac9Q99N13 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Hdac9Q99N13 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hdac9Q99N13 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hdac9Q99N13 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hdac9Q99N13 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hdac9Q99N13 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hdac9Q99N13 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hdac9Q99N13 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdac9Q99N13 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdac9Q99N13 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdac9Q99N13 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdac9Q99N13 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdac9Q99N13 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hdac9Q99N13 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hdac9Q99N13 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hdac9Q99N13 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hdac9Q99N13 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hdac9Q99N13 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hdac9Q99N13 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hdac9Q99N13 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hdac9Q99N13 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac9Q99N13 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac9Q99N13 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac9Q99N13 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hdac9Q99N13 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hdac9Q99N13 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hdac9Q99N13 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms