Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a6cQ99N08 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a6cQ99N08 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms