Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mccc1Q99MR8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mccc1Q99MR8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mccc1Q99MR8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms