Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SrrtQ99MR6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SrrtQ99MR6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SrrtQ99MR6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SrrtQ99MR6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SrrtQ99MR6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SrrtQ99MR6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SrrtQ99MR6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SrrtQ99MR6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SrrtQ99MR6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SrrtQ99MR6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SrrtQ99MR6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SrrtQ99MR6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SrrtQ99MR6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SrrtQ99MR6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SrrtQ99MR6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SrrtQ99MR6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SrrtQ99MR6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SrrtQ99MR6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SrrtQ99MR6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SrrtQ99MR6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SrrtQ99MR6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SrrtQ99MR6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SrrtQ99MR6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SrrtQ99MR6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SrrtQ99MR6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SrrtQ99MR6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms