Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtpbp4Q99ME9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtpbp4Q99ME9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtpbp4Q99ME9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtpbp4Q99ME9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtpbp4Q99ME9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtpbp4Q99ME9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtpbp4Q99ME9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtpbp4Q99ME9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtpbp4Q99ME9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtpbp4Q99ME9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtpbp4Q99ME9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtpbp4Q99ME9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtpbp4Q99ME9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtpbp4Q99ME9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtpbp4Q99ME9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtpbp4Q99ME9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtpbp4Q99ME9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtpbp4Q99ME9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtpbp4Q99ME9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtpbp4Q99ME9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtpbp4Q99ME9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtpbp4Q99ME9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtpbp4Q99ME9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtpbp4Q99ME9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtpbp4Q99ME9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtpbp4Q99ME9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtpbp4Q99ME9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtpbp4Q99ME9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtpbp4Q99ME9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtpbp4Q99ME9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtpbp4Q99ME9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtpbp4Q99ME9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtpbp4Q99ME9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtpbp4Q99ME9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gtpbp4Q99ME9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms