Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99M08 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99M08 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99M08 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99M08 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99M08 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99M08 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99M08 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99M08 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99M08 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99M08 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99M08 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99M08 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99M08 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99M08 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99M08 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99M08 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q99M08 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q99M08 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q99M08 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q99M08 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q99M08 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q99M08 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q99M08 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q99M08 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q99M08 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q99M08 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q99M08 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q99M08 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99M08 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99M08 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99M08 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99M08 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99M08 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99M08 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q99M08 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99M08 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99M08 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99M08 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99M08 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99M08 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99M08 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99M08 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99M08 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q99M08 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99M08 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99M08 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99M08 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99M08 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99M08 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99M08 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q99M08 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99M08 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99M08 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99M08 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99M08 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99M08 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q99M08 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99M08 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99M08 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99M08 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q99M08 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q99M08 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q99M08 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99M08 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99M08 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99M08 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q99M08 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99M08 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99M08 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99M08 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99M08 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q99M08 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q99M08 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99M08 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99M08 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99M08 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99M08 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99M08 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99M08 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99M08 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99M08 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99M08 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99M08 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99M08 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99M08 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99M08 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q99M08 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q99M08 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q99M08 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q99M08 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q99M08 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q99M08 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q99M08 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99M08 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99M08 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99M08 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99M08 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99M08 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99M08 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms