Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lysmd3Q99LE3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lysmd3Q99LE3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lysmd3Q99LE3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lysmd3Q99LE3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lysmd3Q99LE3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lysmd3Q99LE3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lysmd3Q99LE3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lysmd3Q99LE3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lysmd3Q99LE3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lysmd3Q99LE3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lysmd3Q99LE3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lysmd3Q99LE3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lysmd3Q99LE3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lysmd3Q99LE3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lysmd3Q99LE3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lysmd3Q99LE3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms