Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdxdc1Q99K01 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdxdc1Q99K01 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdxdc1Q99K01 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdxdc1Q99K01 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdxdc1Q99K01 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdxdc1Q99K01 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdxdc1Q99K01 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdxdc1Q99K01 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdxdc1Q99K01 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdxdc1Q99K01 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdxdc1Q99K01 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdxdc1Q99K01 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdxdc1Q99K01 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdxdc1Q99K01 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdxdc1Q99K01 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdxdc1Q99K01 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdxdc1Q99K01 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms