Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR6

Nmnat3, Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmnat3Q99JR6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nmnat3Q99JR6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nmnat3Q99JR6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nmnat3Q99JR6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nmnat3Q99JR6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nmnat3Q99JR6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nmnat3Q99JR6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nmnat3Q99JR6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nmnat3Q99JR6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nmnat3Q99JR6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 204.8 ms