Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kdelr1Q99JH8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kdelr1Q99JH8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kdelr1Q99JH8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kdelr1Q99JH8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kdelr1Q99JH8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kdelr1Q99JH8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kdelr1Q99JH8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kdelr1Q99JH8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdelr1Q99JH8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdelr1Q99JH8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdelr1Q99JH8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdelr1Q99JH8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdelr1Q99JH8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdelr1Q99JH8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdelr1Q99JH8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kdelr1Q99JH8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdelr1Q99JH8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kdelr1Q99JH8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdelr1Q99JH8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdelr1Q99JH8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdelr1Q99JH8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdelr1Q99JH8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdelr1Q99JH8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdelr1Q99JH8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdelr1Q99JH8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdelr1Q99JH8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdelr1Q99JH8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdelr1Q99JH8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdelr1Q99JH8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdelr1Q99JH8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdelr1Q99JH8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdelr1Q99JH8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdelr1Q99JH8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdelr1Q99JH8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdelr1Q99JH8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdelr1Q99JH8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdelr1Q99JH8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdelr1Q99JH8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kdelr1Q99JH8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kdelr1Q99JH8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdelr1Q99JH8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdelr1Q99JH8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdelr1Q99JH8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdelr1Q99JH8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdelr1Q99JH8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdelr1Q99JH8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdelr1Q99JH8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdelr1Q99JH8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdelr1Q99JH8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdelr1Q99JH8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdelr1Q99JH8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdelr1Q99JH8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms