Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk9Q99J95 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk9Q99J95 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk9Q99J95 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk9Q99J95 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk9Q99J95 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk9Q99J95 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk9Q99J95 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk9Q99J95 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk9Q99J95 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk9Q99J95 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk9Q99J95 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk9Q99J95 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk9Q99J95 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms