Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAL3ST1Q99999 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAL3ST1Q99999 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAL3ST1Q99999 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAL3ST1Q99999 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAL3ST1Q99999 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAL3ST1Q99999 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAL3ST1Q99999 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAL3ST1Q99999 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAL3ST1Q99999 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST1Q99999 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST1Q99999 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST1Q99999 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST1Q99999 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST1Q99999 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GAL3ST1Q99999 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GAL3ST1Q99999 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GAL3ST1Q99999 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GAL3ST1Q99999 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GAL3ST1Q99999 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GAL3ST1Q99999 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GAL3ST1Q99999 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GAL3ST1Q99999 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GAL3ST1Q99999 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GAL3ST1Q99999 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GAL3ST1Q99999 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.7 ms