Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CGRRF1Q99675 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CGRRF1Q99675 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CGRRF1Q99675 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CGRRF1Q99675 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CGRRF1Q99675 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CGRRF1Q99675 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CGRRF1Q99675 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CGRRF1Q99675 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CGRRF1Q99675 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CGRRF1Q99675 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CGRRF1Q99675 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CGRRF1Q99675 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CGRRF1Q99675 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CGRRF1Q99675 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CGRRF1Q99675 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CGRRF1Q99675 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CGRRF1Q99675 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CGRRF1Q99675 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CGRRF1Q99675 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CGRRF1Q99675 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CGRRF1Q99675 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CGRRF1Q99675 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CGRRF1Q99675 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CGRRF1Q99675 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CGRRF1Q99675 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGRRF1Q99675 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CGRRF1Q99675 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGRRF1Q99675 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CGRRF1Q99675 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CGRRF1Q99675 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CGRRF1Q99675 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CGRRF1Q99675 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGRRF1Q99675 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGRRF1Q99675 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGRRF1Q99675 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGRRF1Q99675 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGRRF1Q99675 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGRRF1Q99675 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGRRF1Q99675 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CGRRF1Q99675 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGRRF1Q99675 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGRRF1Q99675 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGRRF1Q99675 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGRRF1Q99675 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGRRF1Q99675 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGRRF1Q99675 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGRRF1Q99675 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGRRF1Q99675 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGRRF1Q99675 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGRRF1Q99675 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGRRF1Q99675 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGRRF1Q99675 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGRRF1Q99675 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGRRF1Q99675 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGRRF1Q99675 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGRRF1Q99675 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGRRF1Q99675 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms